处理违章扣分的方法如下：
携带证件：
携带本人的身份证、驾驶证和机动车行驶证到违章处理大厅办理。
打印处罚决定书：
在违章处理大厅，工作人员会打印出处罚决定书。
缴纳罚款：
拿着处罚决定书到指定的银行交罚款。处罚决定书一旦打印完毕，必须在15日内交罚款；超过15天的，每天收取3%的滞纳金，滞纳金的总额不能超过罚款的总额。
保留票据：
交完罚款后，务必保留好相关票据，以备后续查询或核对违法信息时使用。
学习考试：
如果在一个记分周期内扣分达到12分，驾驶人需要到指定地点进行相关的学习和考试，考试合格的，扣分才会清除。
建议：
及时处理：发现违章后应尽快处理，避免超过15天的缴纳期限，以免产生额外的滞纳金。
使用交管12123：可以通过交管12123APP处理一些简单的违章扣分，节省时间和精力。
注意学习考试：扣分达到12分时，务必参加学习和考试，以免影响驾驶资格。
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