农村合作医疗（简称“新农合”）的补交后生效时间如下：
补交后下一年生效：
新农合允许补交费用，补交后从下一年的1月1日开始生效，而不是当天缴费当天生效。
等待期：
如果医保断交超过三个月以上，再次缴费将会有6个月的等待期。在这6个月内，即使缴纳了医保费用，也不能享受医保报销待遇，必须累计缴纳6个月后才能继续享受医保待遇。
短期内补交：
如果医保断交在三个月以内，并且当月进行补缴，那么次月即可享受医保待遇。
综上所述，农村合作医疗补交后，一般情况下会在补交当年的1月1日开始生效，但如果存在等待期，则需等待6个月后才可正常使用。建议及时缴纳医保费用，以确保能够顺利享受医疗报销待遇。
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